Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csgalnact2Q8C1F4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms