Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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Rapgef5Q8C0Q9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef5Q8C0Q9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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Rapgef5Q8C0Q9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Rapgef5Q8C0Q9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Rapgef5Q8C0Q9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Rapgef5Q8C0Q9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Rapgef5Q8C0Q9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef5Q8C0Q9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms