Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl38Q8BSF5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl38Q8BSF5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms