Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cc2d1bQ8BRN9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cc2d1bQ8BRN9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms