Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CyldQ80TQ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms