Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc36Q6PDM4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms