Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Herc4Q6PAV2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms