Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx19Q6P4T1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx19Q6P4T1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms