Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 295.7 ms