Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ScinQ60604 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ScinQ60604 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ScinQ60604 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ScinQ60604 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ScinQ60604 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ScinQ60604 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ScinQ60604 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ScinQ60604 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ScinQ60604 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ScinQ60604 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ScinQ60604 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ScinQ60604 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ScinQ60604 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ScinQ60604 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ScinQ60604 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ScinQ60604 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ScinQ60604 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ScinQ60604 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ScinQ60604 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ScinQ60604 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ScinQ60604 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScinQ60604 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ScinQ60604 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ScinQ60604 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ScinQ60604 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScinQ60604 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScinQ60604 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ScinQ60604 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScinQ60604 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScinQ60604 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ScinQ60604 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ScinQ60604 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ScinQ60604 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScinQ60604 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ScinQ60604 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ScinQ60604 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ScinQ60604 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScinQ60604 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ScinQ60604 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScinQ60604 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScinQ60604 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ScinQ60604 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScinQ60604 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScinQ60604 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ScinQ60604 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScinQ60604 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScinQ60604 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScinQ60604 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScinQ60604 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScinQ60604 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScinQ60604 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScinQ60604 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScinQ60604 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScinQ60604 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms