Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trdv4Q5R1A3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trdv4Q5R1A3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms