Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms