Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc114Q3UX62 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc114Q3UX62 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms