Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp30Q3UN04 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp30Q3UN04 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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