Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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