Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M3Q31093 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms