Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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ATXN8Q156A1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATXN8Q156A1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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ATXN8Q156A1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATXN8Q156A1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATXN8Q156A1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATXN8Q156A1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATXN8Q156A1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATXN8Q156A1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATXN8Q156A1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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ATXN8Q156A1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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ATXN8Q156A1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8Q156A1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8Q156A1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8Q156A1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ATXN8Q156A1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8Q156A1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ATXN8Q156A1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8Q156A1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ATXN8Q156A1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ATXN8Q156A1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ATXN8Q156A1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ATXN8Q156A1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATXN8Q156A1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATXN8Q156A1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ATXN8Q156A1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ATXN8Q156A1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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