Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc2Q05020 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms