Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnd1Q03719 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnd1Q03719 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms