Protein–RNA interactions for Protein: Q03526

Itk, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItkQ03526 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItkQ03526 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ItkQ03526 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItkQ03526 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItkQ03526 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItkQ03526 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItkQ03526 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItkQ03526 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItkQ03526 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItkQ03526 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItkQ03526 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItkQ03526 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItkQ03526 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ItkQ03526 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItkQ03526 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItkQ03526 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ItkQ03526 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItkQ03526 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms