Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pax5Q02650 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms