Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB1Q02641 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms