Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa1Q00623 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms