Protein–RNA interactions for Protein: P68037

Ube2l3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2l3P68037 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2l3P68037 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2l3P68037 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms