Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm5P62322 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms