Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HpdP49429 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HpdP49429 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HpdP49429 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HpdP49429 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HpdP49429 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HpdP49429 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HpdP49429 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HpdP49429 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HpdP49429 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HpdP49429 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HpdP49429 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HpdP49429 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HpdP49429 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HpdP49429 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HpdP49429 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HpdP49429 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HpdP49429 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HpdP49429 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HpdP49429 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HpdP49429 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HpdP49429 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HpdP49429 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HpdP49429 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HpdP49429 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HpdP49429 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HpdP49429 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HpdP49429 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HpdP49429 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HpdP49429 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HpdP49429 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HpdP49429 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HpdP49429 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HpdP49429 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HpdP49429 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HpdP49429 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HpdP49429 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HpdP49429 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HpdP49429 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HpdP49429 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HpdP49429 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HpdP49429 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HpdP49429 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HpdP49429 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HpdP49429 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HpdP49429 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HpdP49429 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HpdP49429 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HpdP49429 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HpdP49429 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HpdP49429 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HpdP49429 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HpdP49429 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HpdP49429 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HpdP49429 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HpdP49429 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HpdP49429 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HpdP49429 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpdP49429 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpdP49429 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpdP49429 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpdP49429 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpdP49429 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpdP49429 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpdP49429 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpdP49429 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpdP49429 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpdP49429 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpdP49429 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpdP49429 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpdP49429 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpdP49429 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpdP49429 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpdP49429 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HpdP49429 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpdP49429 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpdP49429 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpdP49429 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpdP49429 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpdP49429 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HpdP49429 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HpdP49429 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HpdP49429 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms