Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VdrP48281 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VdrP48281 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VdrP48281 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VdrP48281 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VdrP48281 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VdrP48281 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VdrP48281 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VdrP48281 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VdrP48281 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VdrP48281 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VdrP48281 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VdrP48281 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VdrP48281 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VdrP48281 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VdrP48281 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VdrP48281 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VdrP48281 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VdrP48281 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VdrP48281 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VdrP48281 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VdrP48281 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VdrP48281 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VdrP48281 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VdrP48281 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VdrP48281 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VdrP48281 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VdrP48281 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VdrP48281 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VdrP48281 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VdrP48281 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VdrP48281 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VdrP48281 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VdrP48281 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VdrP48281 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VdrP48281 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VdrP48281 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VdrP48281 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VdrP48281 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VdrP48281 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VdrP48281 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VdrP48281 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VdrP48281 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VdrP48281 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VdrP48281 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VdrP48281 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VdrP48281 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VdrP48281 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VdrP48281 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VdrP48281 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VdrP48281 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VdrP48281 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VdrP48281 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VdrP48281 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VdrP48281 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VdrP48281 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VdrP48281 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VdrP48281 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VdrP48281 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VdrP48281 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VdrP48281 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VdrP48281 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VdrP48281 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VdrP48281 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VdrP48281 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VdrP48281 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VdrP48281 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VdrP48281 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VdrP48281 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VdrP48281 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VdrP48281 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VdrP48281 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VdrP48281 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
VdrP48281 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VdrP48281 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VdrP48281 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VdrP48281 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VdrP48281 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VdrP48281 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VdrP48281 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VdrP48281 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VdrP48281 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VdrP48281 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VdrP48281 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VdrP48281 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VdrP48281 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VdrP48281 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VdrP48281 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VdrP48281 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms