Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igfbp3P47878 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igfbp3P47878 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Igfbp3P47878 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms