Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg3P47867 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg3P47867 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg3P47867 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg3P47867 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg3P47867 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg3P47867 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg3P47867 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scg3P47867 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scg3P47867 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg3P47867 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg3P47867 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg3P47867 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg3P47867 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg3P47867 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Scg3P47867 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg3P47867 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg3P47867 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg3P47867 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scg3P47867 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Scg3P47867 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Scg3P47867 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg3P47867 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg3P47867 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Scg3P47867 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg3P47867 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg3P47867 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms