Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp13P33435 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp13P33435 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp13P33435 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms