Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh15P33146 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh15P33146 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms