Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnga1P29974 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnga1P29974 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms