Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja8P28236 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja8P28236 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja8P28236 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja8P28236 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gja8P28236 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja8P28236 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja8P28236 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja8P28236 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja8P28236 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja8P28236 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja8P28236 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja8P28236 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja8P28236 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms