Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Twist1P26687 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Twist1P26687 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Twist1P26687 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Twist1P26687 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Twist1P26687 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Twist1P26687 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Twist1P26687 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Twist1P26687 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms