Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PdgfaP20033 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfaP20033 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PdgfaP20033 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms