Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfrbP05622 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfrbP05622 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrbP05622 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms