Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01748 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01748 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01748 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01748 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01748 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01748 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01748 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01748 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01748 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01748 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01748 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01748 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01748 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01748 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01748 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01748 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01748 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01748 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01748 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01748 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01748 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01748 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01748 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01748 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01748 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01748 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01748 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01748 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01748 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01748 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01748 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01748 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01748 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01748 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01748 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01748 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01748 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01748 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01748 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01748 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01748 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01748 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01748 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01748 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01748 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01748 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01748 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01748 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01748 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01748 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01748 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01748 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01748 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01748 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01748 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01748 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01748 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01748 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01748 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01748 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01748 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms