Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01728 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01728 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01728 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01728 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01728 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01728 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01728 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01728 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01728 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01728 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01728 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01728 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01728 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01728 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01728 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01728 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01728 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01728 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01728 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01728 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01728 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01728 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01728 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01728 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01728 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01728 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01728 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01728 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01728 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01728 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01728 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01728 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01728 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01728 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01728 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01728 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01728 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01728 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01728 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01728 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01728 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01728 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01728 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01728 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01728 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01728 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01728 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01728 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01728 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01728 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01728 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01728 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01728 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01728 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01728 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01728 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01728 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01728 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01728 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01728 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01728 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01728 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01728 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01728 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01728 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01728 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01728 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01728 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01728 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01728 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01728 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01728 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01728 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01728 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01728 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01728 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01728 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01728 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01728 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01728 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms