Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AvilO88398 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AvilO88398 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AvilO88398 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AvilO88398 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AvilO88398 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AvilO88398 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AvilO88398 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AvilO88398 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AvilO88398 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AvilO88398 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AvilO88398 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AvilO88398 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AvilO88398 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AvilO88398 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AvilO88398 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AvilO88398 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AvilO88398 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AvilO88398 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AvilO88398 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AvilO88398 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AvilO88398 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AvilO88398 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AvilO88398 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AvilO88398 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AvilO88398 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AvilO88398 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AvilO88398 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AvilO88398 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AvilO88398 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AvilO88398 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AvilO88398 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AvilO88398 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AvilO88398 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AvilO88398 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AvilO88398 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AvilO88398 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AvilO88398 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AvilO88398 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AvilO88398 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AvilO88398 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AvilO88398 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AvilO88398 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AvilO88398 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AvilO88398 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AvilO88398 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AvilO88398 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AvilO88398 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AvilO88398 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AvilO88398 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AvilO88398 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AvilO88398 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AvilO88398 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AvilO88398 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AvilO88398 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AvilO88398 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AvilO88398 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AvilO88398 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AvilO88398 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AvilO88398 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AvilO88398 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AvilO88398 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AvilO88398 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AvilO88398 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AvilO88398 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AvilO88398 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AvilO88398 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AvilO88398 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AvilO88398 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AvilO88398 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AvilO88398 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AvilO88398 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AvilO88398 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AvilO88398 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AvilO88398 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AvilO88398 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AvilO88398 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AvilO88398 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AvilO88398 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AvilO88398 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AvilO88398 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AvilO88398 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AvilO88398 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AvilO88398 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AvilO88398 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AvilO88398 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AvilO88398 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AvilO88398 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AvilO88398 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AvilO88398 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AvilO88398 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AvilO88398 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AvilO88398 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AvilO88398 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AvilO88398 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AvilO88398 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AvilO88398 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AvilO88398 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AvilO88398 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AvilO88398 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms