Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnnt1O88346 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tnnt1O88346 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tnnt1O88346 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms