Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmx1O70218 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmx1O70218 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms