Protein–RNA interactions for Protein: O54828

Rgs9, Regulator of G-protein signaling 9, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs9O54828 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rgs9O54828 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rgs9O54828 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rgs9O54828 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rgs9O54828 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rgs9O54828 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rgs9O54828 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rgs9O54828 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rgs9O54828 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rgs9O54828 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rgs9O54828 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rgs9O54828 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms