Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8050L7N2E3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm8050L7N2E3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms