Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccer2J3QPU5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccer2J3QPU5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccer2J3QPU5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms