Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20914J3QME2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20914J3QME2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20914J3QME2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20914J3QME2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms