Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms