Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h12bG3X9I7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12bG3X9I7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms