Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3371F7CQW8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3371F7CQW8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3371F7CQW8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.2 ms