Protein–RNA interactions for Protein: E9PXJ7

Gm20458, Predicted gene 20458, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20458E9PXJ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20458E9PXJ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20458E9PXJ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20458E9PXJ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms