Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc78D3Z5T1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms