Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5930D3Z257 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5930D3Z257 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5930D3Z257 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms